Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX27Q96GQ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX27Q96GQ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms