Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TOP1MTQ969P6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOP1MTQ969P6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms