Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF398Q8TD17 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms