Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO3Q8TAP4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO3Q8TAP4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms