Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA6DQ8NFY4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms