Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE22Q8NFJ8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE22Q8NFJ8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms