Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
COLGALT1Q8NBJ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLGALT1Q8NBJ5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms