Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38AQ8NAV1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms