Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHTF2Q8N3S3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHTF2Q8N3S3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms