Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms