Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC83Q8IWF9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC83Q8IWF9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms