Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfrp1Q8BXL7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms