Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna12Q80SS5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna12Q80SS5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms