Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX20Q7Z614 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms