Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZD4Q76G19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD4Q76G19 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms