Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMC5Q6UXY8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC5Q6UXY8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC5Q6UXY8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms