Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC4A10Q6U841 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A10Q6U841 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms