Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF40BQ6NWY9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
PRPF40BQ6NWY9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40BQ6NWY9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms