Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CREB3L3Q68CJ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CREB3L3Q68CJ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CREB3L3Q68CJ9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms