Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf135Q5VTT2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf135Q5VTT2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms