Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC38Q5R3I4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms