Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

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Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1EQ15878 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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