Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP5Q15291 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP5Q15291 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP5Q15291 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP5Q15291 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP5Q15291 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP5Q15291 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP5Q15291 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBBP5Q15291 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP5Q15291 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP5Q15291 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP5Q15291 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP5Q15291 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP5Q15291 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP5Q15291 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms