Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NECTIN1Q15223 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NECTIN1Q15223 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NECTIN1Q15223 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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