Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFR3AQ14156 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFR3AQ14156 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms