Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EIF3AQ14152 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EIF3AQ14152 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms