Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1DQ13901 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1DQ13901 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1DQ13901 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C1DQ13901 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C1DQ13901 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C1DQ13901 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C1DQ13901 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C1DQ13901 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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