Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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ITGA9Q13797 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA9Q13797 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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