Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGDRQ13258 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGDRQ13258 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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