Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 SCY1YGL083W 2415 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 GPI8YDR331W 1236 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 UBC12YLR306W 567 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 PHO88YBR106W 567 nt3.76□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 CEP3YMR168C 1827 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 DET1YDR051C 1005 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 YHB1YGR234W 1200 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.75□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 YIL174WYIL174W 228 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 RPC19YNL113W 429 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 YBR116CYBR116C 528 nt3.74□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 GAS5YOL030W 1455 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 SCD5YOR329C 2619 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 RPS21BYJL136C 264 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 COG3YER157W 2406 nt3.73□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 GDI1YER136W 1356 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 RMT2YDR465C 1239 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 MST27YGL051W 705 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 REG2YBR050C 1017 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 RDH54YBR073W 2877 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 IOC2YLR095C 2439 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 TGL1YKL140W 1647 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 ALG2YGL065C 1512 nt3.72□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 UBP14YBR058C 2346 nt3.71□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 SEC31YDL195W 3822 nt3.71□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 RSM10YDR041W 612 nt3.71□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 PFF1YBR074W 2931 nt3.71□□□□□ -1.81
TY1B-GR3Q12316 ICR1ICR1 3199 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 NGL3YML118W 1518 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 POL1YNL102W 4407 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 YOR055WYOR055W 435 nt3.71□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 YGR291CYGR291C 222 nt3.7□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 NAT5YOR253W 531 nt3.7□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 LCL1YPL056C 306 nt3.7□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 RAV1YJR033C 4074 nt3.7□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 YFR016CYFR016C 3702 nt3.69□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 YKL066WYKL066W 444 nt3.69□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 KIN28YDL108W 921 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 NNF1YJR112W 606 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 PAU17YLL025W 375 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 SAP1YER047C 2694 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 SEC14YMR079W 915 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 NCE102YPR149W 522 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 ERV1YGR029W 570 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 YPR150WYPR150W 522 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 KEL2YGR238C 2649 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 ORC6YHR118C 1308 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 YGR067CYGR067C 2415 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 TCD1YHR003C 1290 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 TDA9YML081W 3756 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 RPL20BYOR312C 519 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 YPR015CYPR015C 744 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 MCM4YPR019W 2802 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 YCL007CYCL007C 393 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 YLL037WYLL037W 381 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 NAM9YNL137C 1461 nt3.65□□□□□ -1.82
TY1B-GR3Q12316 DOS2YDR068W 933 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 TOM20YGR082W 552 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 MEF2YJL102W 2460 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 ANT1YPR128C 987 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 RPS22BYLR367W 393 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 RRP36YOR287C 903 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 YPL014WYPL014W 1146 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 VPS33YLR396C 2076 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 SER3YER081W 1410 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 INO2YDR123C 915 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 STE2YFL026W 1296 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 CAP2YIL034C 864 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 RMA1YKL132C 1293 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 RPN13YLR421C 471 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 GCD10YNL062C 1437 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 RSC3YDR303C 2658 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 PDR11YIL013C 4236 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 UFD4YKL010C 4452 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 YBR226CYBR226C 411 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 CLN2YPL256C 1638 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 SDC25YLL016W 3147 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 YFL015CYFL015C 495 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 VPS51YKR020W 495 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 MRD1YPR112C 2664 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 PNC1YGL037C 651 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 SIN3YOL004W 4611 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 KTR6YPL053C 1341 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 MYO3YKL129C 3819 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 VPS45YGL095C 1734 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 TTI2YJR136C 1266 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 DOM34YNL001W 1161 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 UTP22YGR090W 3714 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 YEF3YLR249W 3135 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 KIP3YGL216W 2418 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 SIC1YLR079W 855 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1B-GR3Q12316 ECI1YLR284C 843 nt3.59□□□□□ -1.83
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