Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 TTI2YJR136C 1266 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 GTT2YLL060C 702 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RAD14YMR201C 1116 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 LDS2YOL047C 1071 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 RPS7AYOR096W 573 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MCM16YPR046W 546 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MRS2YOR334W 1413 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 MTH1YDR277C 1302 nt2.91□□□□□ -1.94
USB1Q12208 POL31YJR006W 1464 nt2.9□□□□□ -1.94
USB1Q12208 TEC1YBR083W 1461 nt2.9□□□□□ -1.94
USB1Q12208 IOC3YFR013W 2364 nt2.9□□□□□ -1.94
USB1Q12208 AKR1YDR264C 2295 nt2.9□□□□□ -1.94
USB1Q12208 STU2YLR045C 2667 nt2.9□□□□□ -1.94
USB1Q12208 BUD30YDL151C 582 nt2.9□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YHP1YDR451C 1062 nt2.9□□□□□ -1.95
USB1Q12208 MRPL49YJL096W 486 nt2.9□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YDR089WYDR089W 2610 nt2.9□□□□□ -1.95
USB1Q12208 STE6YKL209C 3873 nt2.9□□□□□ -1.95
USB1Q12208 BCH1YMR237W 2175 nt2.9□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YGR237CYGR237C 2358 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 TCP1YDR212W 1680 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 GRX6YDL010W 696 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YFL065CYFL065C 309 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 TOS8YGL096W 831 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 LST7YGR057C 729 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 ARG2YJL071W 1725 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 SMC3YJL074C 3693 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 HFD1YMR110C 1599 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 OCA2YNL056W 594 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 TPM1YNL079C 600 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 MPD1YOR288C 957 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YBR242WYBR242W 717 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YSP2YDR326C 4317 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 SIZ1YDR409W 2715 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YAT2YER024W 2772 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 ATP25YMR098C 1839 nt2.89□□□□□ -1.95
USB1Q12208 CHK1YBR274W 1584 nt2.88□□□□□ -1.95
USB1Q12208 MAK21YDR060W 3078 nt2.88□□□□□ -1.95
USB1Q12208 CLB3YDL155W 1284 nt2.88□□□□□ -1.95
USB1Q12208 ECO1YFR027W 846 nt2.88□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YUH1YJR099W 711 nt2.88□□□□□ -1.95
USB1Q12208 OST6YML019W 999 nt2.88□□□□□ -1.95
USB1Q12208 AGA1YNR044W 2178 nt2.88□□□□□ -1.95
USB1Q12208 FLO5YHR211W 3228 nt2.88□□□□□ -1.95
USB1Q12208 CMK1YFR014C 1341 nt2.88□□□□□ -1.95
USB1Q12208 TPD3YAL016W 1908 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 STP2YHR006W 1626 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 EMP70YLR083C 2004 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 REC8YPR007C 2043 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YGL214WYGL214W 486 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YIR014WYIR014W 729 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 RPL22AYLR061W 366 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 CDA2YLR308W 939 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 RAD33YML011C 534 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 TRI1YMR233W 681 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 IMP4YNL075W 873 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YBL077WYBL077W 432 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 RFC3YNL290W 1023 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YNL320WYNL320W 855 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YOR338WYOR338W 1092 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 PKH1YDR490C 2301 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 CUS1YMR240C 1311 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 BCS1YDR375C 1371 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 GYP6YJL044C 1377 nt2.87□□□□□ -1.95
USB1Q12208 PRR2YDL214C 2100 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 ENA5YDR038C 3276 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 RMD1YDL001W 1293 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 BUR6YER159C 429 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YIL086CYIL086C 309 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 PET130YJL023C 1044 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 PCD1YLR151C 1023 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 BUR2YLR226W 1188 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YLR326WYLR326W 723 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 HUT1YPL244C 1020 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 CTF18YMR078C 2226 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 DNM1YLL001W 2274 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YMR1YJR110W 2067 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YFL040WYFL040W 1623 nt2.86□□□□□ -1.95
USB1Q12208 RCY1YJL204C 2523 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YCR007CYCR007C 720 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YDR391CYDR391C 699 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 RRP17YDR412W 708 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 PUG1YER185W 912 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 FMP32YFL046W 624 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 RPS23AYGR118W 438 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YJR111CYJR111C 852 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 RLP7YNL002C 969 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 GIS2YNL255C 462 nt2.85□□□□□ -1.95
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