Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms