Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata4Q08369 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms