Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP3CAQ08209 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms