Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF17Q02223 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms