Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFITM3Q01628 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFITM3Q01628 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms