Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKB2Q00653 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKB2Q00653 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFKB2Q00653 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKB2Q00653 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKB2Q00653 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFKB2Q00653 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFKB2Q00653 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFKB2Q00653 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFKB2Q00653 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFKB2Q00653 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKB2Q00653 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFKB2Q00653 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKB2Q00653 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFKB2Q00653 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKB2Q00653 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFKB2Q00653 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFKB2Q00653 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFKB2Q00653 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFKB2Q00653 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms