Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms