Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC5P78333 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC5P78333 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC5P78333 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC5P78333 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC5P78333 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC5P78333 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC5P78333 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms