Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms