Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCCD1P59942 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms