Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX16P57768 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX16P57768 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX16P57768 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX16P57768 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX16P57768 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms