Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST1P52848 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST1P52848 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST1P52848 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST1P52848 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST1P52848 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST1P52848 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST1P52848 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST1P52848 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST1P52848 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST1P52848 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST1P52848 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST1P52848 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST1P52848 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST1P52848 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST1P52848 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST1P52848 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST1P52848 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST1P52848 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST1P52848 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms