Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK3P51956 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK3P51956 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK3P51956 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK3P51956 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK3P51956 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK3P51956 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK3P51956 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK3P51956 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms