Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8P50990 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8P50990 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8P50990 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8P50990 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8P50990 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8P50990 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT8P50990 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8P50990 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8P50990 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8P50990 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8P50990 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8P50990 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8P50990 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8P50990 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8P50990 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT8P50990 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT8P50990 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT8P50990 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT8P50990 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT8P50990 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT8P50990 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT8P50990 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT8P50990 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8P50990 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT8P50990 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms