Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXNP49023 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXNP49023 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXNP49023 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXNP49023 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXNP49023 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXNP49023 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PXNP49023 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXNP49023 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXNP49023 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXNP49023 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PXNP49023 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXNP49023 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PXNP49023 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PXNP49023 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PXNP49023 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXNP49023 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXNP49023 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms