Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS9P46781 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS9P46781 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS9P46781 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS9P46781 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS9P46781 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS9P46781 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS9P46781 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS9P46781 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS9P46781 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS9P46781 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS9P46781 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS9P46781 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS9P46781 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS9P46781 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS9P46781 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS9P46781 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms