Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTTP42858 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTTP42858 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTTP42858 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTTP42858 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTTP42858 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTTP42858 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTTP42858 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTTP42858 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTTP42858 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTTP42858 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HTTP42858 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTTP42858 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTTP42858 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTTP42858 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTTP42858 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTTP42858 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HTTP42858 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTTP42858 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTTP42858 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTTP42858 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTTP42858 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTTP42858 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTTP42858 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms