Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHKAP35790 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHKAP35790 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKAP35790 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKAP35790 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKAP35790 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKAP35790 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKAP35790 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKAP35790 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKAP35790 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKAP35790 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKAP35790 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKAP35790 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKAP35790 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKAP35790 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKAP35790 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKAP35790 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKAP35790 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKAP35790 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKAP35790 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKAP35790 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKAP35790 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKAP35790 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKAP35790 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKAP35790 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKAP35790 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms