Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR1P32246 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR1P32246 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR1P32246 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR1P32246 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR1P32246 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR1P32246 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR1P32246 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR1P32246 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR1P32246 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR1P32246 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR1P32246 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR1P32246 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR1P32246 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR1P32246 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR1P32246 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms